デア=グランドを統べる神帝は、巫女を使って世界を救う儀式を行い、創造主・グランディアを呼び出そうとしていた。一方、セーレスを失い、ユーノを連れ去られたたくやは、ユーノを救うために神帝の城へ進入する。だが、神帝を追い詰めるたくやの前に立ちはだかったのは、成長し偽の記憶を植えつけられたユーノだった…。